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崔学峰

发布时间:2020-03-31 编辑:林喜文 来源:

崔学峰(博士)

职位

l 计算机科学与技术学院 教授

l 山东大学 杰出中青年

工作经历

l 教授,山东大学 计算机科学与技术学院,20199-至今

l 助理教授,清华大学 交叉信息研究院,201610-20197

l 博士后,沙特阿拉伯 阿卜杜拉国王科技大学 生物信息研究中心,20146-20168

教育背景

l 博士学位,加拿大 滑铁卢大学 计算机科学学院,2014

l 硕士学位,加拿大 滑铁卢大学 计算机科学学院,2007

l 学士学位,加拿大 滑铁卢大学 计算机科学学院,2004

科研兴趣

        我对发现和解决与日常生活息息相关的计算问题有着浓厚的兴趣。这包括设计和应用深度学习和并行算法来攻克生物信息难题。我近期的主要研究工作包括以下生物信息问题:

l 基于冷冻电镜的分子结构检测

l 基于多肽疫苗的新抗原设计

l 基于宏基因组大数据的抗生素抗性基因挖掘

教学课程

l 生物信息学

l 并行算法设计与实践

发表论文(部分)

l Yaosen Min, Shang Liu, and Xuefeng Cui Learning protein structural fingerprints under the label-free supervision of domain knowledge Published on IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (IEEE-BIBM), Madrid, Spain, December 3-6, 2018

l Xuefeng Cui, Zhiwu Lu, Sheng Wang, Jim Jing-Yan Wang, and Xin Gao CMsearch: simultaneous exploration of protein sequence space and structure space improves not only protein homology detection but also structure prediction Published on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB), Orlando, Florida, U.S.A, July 8-12, 2016

l Xuefeng Cui, Hammad Naveed, and Xin Gao Finding optimal interaction interface alignments between biological complexes Published on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB), Dublin, Ireland, July 10-14, 2015

l Xuefeng Cui, Hiroyuki Kuwahara, Shuai Cheng Li, and Xin Gao Compare local pocket and global protein structure models by small structure patterns Published on ACM International Conference on Bioinformatics, Computational Biology, and Health Informatics (ACM-BCB), Atlanta, U.S.A, September 9-12, 2015

l Xuefeng Cui, Tomas Vinar, Brona Brejova, Dennis Shasha, and Ming Li Homology search for genes Published on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB), Vienna, Austria, July 21-25, 2007



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